Химия микроорганизмов
Микробы, как и все прочие организмы, возникли в процессе эволюции из элементов, широко представленных на Земле.
Химические элементы
Ультрамиркоэлементы – бор, ванадий,
железо, кремний, марганец, медь,
молибден, цинк.
менее 0,001 атомных долей, %
Свойства основных элементов
- Они самые легкие среди элементов, способных образовывать прочные ковалентные связи благодаря спариванию электронов.
- Легко взаимодействуют друг с другом.
- N, O и C могут образовывать ординарныеи двойные связи, благодаря которым резко возрастает число образуемых соединений
- C способен образовывать тройные связи с другими атомами C и N.
- С может образовывать C-C связи, благодаря чему возможно формирование бесчисленного количества разнообразных органических молекул
- Соединения C обладают различной трехмерной структурой благодаря образованию тетраэдрической конфигурации вокруг каждого атома C за счет спаренных электронов.
Микроэлементы – универсальные элементы
- Имеют структурно-функциональное значение для всех видов живых клеток.
- В течение миллиардов лет в клетках сохраняется более или менее постоянный ионный баланс, характерный для морской воды (при меньших концентрациях)
Малые молекулы:
- Молекулы-предшественники (поступают
в клетку из вне): H 2 O, CO 2 , N 2 , Mg 2+ , Ca 2+ , NO 3 -, SO 4 2-, PO 4 2-,
Cl-, K+ и др.
- Промежуточные молекулы органических кислот, рибозы;
- Молекулы строительных блоков: аминокислоты,
- мононуклеотиды, монозы и низшие олигозы, глицерин,
- жирные кислоты
7 (у бактерий) и ниже " width="640"
Малые молекулы . Вода.
- Молекула воды относится к малым молекулам, ее значение в жизнедеятельности микроорганизмов огромно.
- Молекулы воды легко взаимодействуют друг с другом, образуя межмолекулярные водородные связи.
- Вода в виде гидратных оболочек экранирует противоположнозаряженные молекулы, способствуя их стабилизации в дисперсной среде.
- Вода имеет высокие показатели диэлектрической проницаемости, поверхностного натяжения и теплоемкости, благодаря которым она выступает растворителем для многих веществ, электростатическим и тепловым буфером.
- Теплоемкость клеток разных микробов является относительно стабильным свойством и в значительной мере определяется содержанием в них воды.
- Значение pH интактных клеток микроорганизмов может быть 7 (у бактерий) и ниже
Разделение микроорганизмов по отношению к температуре
Малые молекулы . Диоксид углерода
- Цианобактерии, зеленые и красные водоросли используют CO 2 в качестве единственного источника углерода:
В последствии происходит синтез глюкозы.
Данный путь фиксации CO 2 осуществляется автотрофными организмами
- Гетеротрофный путь фиксация CO 2 (пропионовые бактерии):
Малые молекулы. Азот.
- Для жизненного важных молекул (нуклеиновых кислот, белков) микроорганизмы нуждаются в азоте.
- Потребители молекулярного азота: цианобактерии, симбионты, азотфиксаторы (азотобактерии, актиномицеты, некоторые вибрионы, микобактерии, спириллы, спирохеты)
- Азотофиксаторы – симбионты, ризобактерии и актиномицеты – выявлены в клубеньках бобовых растений, ботного мирта, лоха, облепихи, ольхи.
- Представителями симбионтов являются лишайники, в которых цианобактерии и зеленые водоросли фиксируют молекулярный азот.
Малые молекулы
- Другие малые молекулы-предшественники необходимы для синтеза молекул – строительных блоков, а также для ускорения разнообразных каталитических процессов
- Магний – имеет отношение более чем к 20 ферментативным реакциям, необходим для функционирования рибосом
- Калий – важен для синтеза белка
- Кобальт – входит в состав витамина В 12
- Кальций – важный компонент эндоспор у бактерий
- Медь и железо – имеют прямое отношение к цитохромам, некоторым пигментным структурам (меланинам, гемопротеинам и др.)
- Металлы весом более 55 не активируют деятельность биокатализаторов. Олигодинамическое действие некоторых металлов связано с токсическим действием малых катионов, тогда как тяжелые металлы необратимо блокируют белковые молекулы, содержащие группы -SH
Малые молекулы . Органические кислоты
- Как промежуточные соединения органические кислоты являются исходным материалом для биосинтеза ряда строительных блоков (аминокислот, глицина,жирных кислот, мононуклеотидов, моноз и низших олигоз, или простых сахаров)
- Атом серы в некоторых аминокислотах первично имеет экзогенное происхождение из малых серосодержащих молекул неорганического ряда. В последующем, он может переносится с помощью ферментативных реакций с одних молекул аминокислот на другие.
- Основной продукт в обменных процессах – пировиноградная кислота
- Прежде всего речь идет о фосфоенолпирувате
- Первичный синтез пирувата из простейших малых молекул у ряда организмов происходит путем образования его из многих аминокислот у гетеротрофных видов:
Макромолекулы
- Важнейшие макромолекулы клеток любых организмов – белки состоят из мономерных единиц – аминокислот, определяющих основные свойства полимеров. Большое значение при этом имеет тип аминокислот, порядок их соединения и пространственное взаимодействие между аминокислотами.
- Известно около 300 аминокислот, при этом в образовании белков участвуют лишь 20 (только L- α -аминокислоты)
- Наличие карбоксильной и аминогруппы обеспечивает аминокислотам способность взаимодействовать с соответствующими ингредиентами в реакциях ацилирования, солеобразования и этерификации.
- Главнейшая реакция аминокислот в клетке – образование пептидной связи.
- В отдельных случаях некоторые аминокислоты служат исходным продуктом для синтеза органических аминов, пуринов и других веществ.
Природные аминокислоты в белках микроорганизмов
Природные аминокислоты в белках микроорганизмов (продолжение)
- Являются компонентами липидов в клеточных мембранах, в виде свободных липидов (включений) могут находится в клетках различных микроорганизмов.
- Различают насыщенные(пальмитиновая, лауриновая, миристиновая, стеариновую и т.д.) и ненасыщенные(олеиновая, леноленовая, ленолевая и.т.д.) жирные кислоты.
- Наличие двойных и связей в молекулах ряда жирных кислот определяет возможность их цис- и транс-конфигураций. В транс-форме жирные кислоты более стабильны.
- Липиды с большим содержанием ненасыщенных жирных кислот будут менее вязкими и, наоборот, липиды с большим содержанием насыщенных кислот будут более вязкими.
Простые сахара (монозы) и низшие олигозы
- Монозы – первичные малые биомолекулы: триозы (глицериновый альдегид); тетрозы (эритроза); пентозы(рибоза, арабиноза, ксилоза); гексозы (аллоза, альтоза, глюкоза, манноза, идоза, галактоза)
Продолжение
- К простым сахарам относятся низшие олигосахариды, включающие от 2 до 5 моноз
- Низший олигосахарид-биоза – мальтоза:состоит из 2-х остатков глюкозы
- К гетероолигосахаридам относится сахароза: состоит из остатков глюкозы и фруктозы
- Трисахариды (триаозы), тетраозы, пентаозы, а также высшие олигозы у микроорганизмов не обнаружены.
- Монозы и олигозы играют огромную роль как энергосубстраты и структурные блоки полисахаридов.
- Важная группа малых внутриклеточных молекул, участвующих в формировании структур, хранящих наследственную информацию.
- Существуют в полимерной (нуклеиновые кислоты) и в мономерной формах (свободном состоянии).
- R – один из остатков пуриновых(аденин, гуанин) или пиримидиновых(тимин, урацил, цитозин) оснований:
- .
Продолжение
- АТФ – аденозинтрифосфат – универсальный источник энергии
Мононуклеотиды могут быть структурной частью ряда витаминов